0104動力エネルギー ガソリンエンジンおよびディーゼルエンジンともに 正味最高熱効率５０％超を「産産学学連携」で達成
乗用車用のガソリンエンジンおよびディーゼルエンジンともに、正味最高熱効率５０％を上回ることに成功した。超希薄燃焼（ガソリン）と高速空間燃焼（ディーゼル）という燃焼技術と、両エンジン共通の損失低減技術をそれぞれ統合した結果得られた。
京都大学
0104動力エネルギー 
2005放射線防護 福島第一原発事故後の安定ヨウ素剤配布後の実態調査を実施
福島第一原発事故後の三春町（福島県田村郡）の小児における安定ヨウ素剤配布後の内服実態調査結果をまとめた。
2004放射線利用 放射線がん治療におけるDNA切断反応を実時間で観測することに成功
放射線によるDNA損傷の過程のうち、およそ10億分の1秒以下のごく短時間で引き起こされる超高速反応の直接観測に世界で初めて成功した。
1701物理及び化学 宇宙線発生の仕組みを利用した新たな加速器を提案
レーザー光を球表の水素クラスターに照射し、衝撃波を生成・増強させて陽子線を加速させる仕組みを発見。相対性理論の効果による陽子線の圧縮とプラズマ電場による陽子線の追加速の効果を同期させて、陽子線の品質とエネルギーを向上させる仕組みを発見。
1202農芸化学 広範囲の植物病原糸状菌が分泌する感染因子の機能を解明
広範囲の植物病原糸状菌が共通してもっているエフェクター「NIS1」が、植物の病原体認識機構の中枢を攻撃していることを発見した。さらに、イネいもち病菌においては、NIS1の喪失によって病原性が劇的に低下することも確認できた。
0403電子応用 新たなフォトニック結晶構造を用いて半導体レーザーの高輝度化に成功
光出射面積を従来の半導体レーザーの1万倍以上大きくしてもビーム品質劣化がない、新たな「２重格子フォトニック結晶」を考案し、10Ｗ級の高出力でありながら、ビーム拡がり角が極めて狭く、極めて高いビーム品質を達成し、高安定・高輝度動作に成功した。
0502有機化学製品 多くの創薬標的受容体（GPCR）を耐熱化する共通の方法を発見
ヒトGPCRであるムスカリンM2受容体やプロスタグランジンEP4受容体に対する耐熱化変異体（耐熱化置換体）を同定し、X線結晶構造解析を用いて両受容体の立体構造の解明に成功した。
2004放射線利用 高温超伝導を用いた粒子加速器用電磁石の機能実証に成功
加速器応用に向けた高温超伝導電磁石を開発し、実証実験を重粒子線がん治療装置にて行った。2.4テスラという高い磁界によるがん治療用炭素イオンビームの誘導を実証し、磁界を繰り返し速く変化させても電磁石を安定して運転できることを確認した。
0403電子応用 次世代の指向性白色光源の開発に成功 ～ナノアンテナで明日を照らす～
金属ナノシリンダー周期アレイ構造を蛍光体基板上に作製することで、蛍光の方向を揃える「ナノアンテナ」として働き、青色と蛍光の放射方向を揃え、指向性を持った白色光を作り出すことができた。また、アレイのない基板に比べ最大7倍にまで高められた。
0502有機化学製品 多孔性結晶の表面の細やかな変化を原子間力顕微鏡でリアルタイム観察することに成功
原子間力顕微鏡という顕微鏡を利用して直接結晶の表面を観察することで、多孔性配位高分子（PCP）と呼ばれる多孔性結晶の表面が外環境に存在する分子を認識して非常に柔軟に変形していることを、世界で初めて明らかにした。
0502有機化学製品 プロスタグランジン受容体の立体構造を世界初解明
急性炎症の痛みや腫れ、発熱、さらに動物のストレス行動、慢性炎症やがんにも関与するプロスタグランジン（PG）の、受容体の立体構造を世界で初めてX線結晶構造解析によって解明した。
1304森林環境 地下の菌類のネットワークが森林の安定と変化の原動力であることを解明
大規模野外操作実験によって、地下の菌類のネットワークが生み出す土壌環境の変化が森林を形作る重要な要因であることを明らかにした。