絶滅危惧種・ミヤコサワガニの局所スケールでの遺伝的隔離と多様性の低さが明らかに ―保全に向けた基盤情報の提供に貢献―

2026-05-14 兵庫県立大学

兵庫県立大学、産業技術総合研究所、東京大学、愛媛大学、沖縄県立芸術大学などの研究グループは、沖縄県宮古島固有の絶滅危惧種ミヤコサワガニ(Geothelphusa miyakoensis)について、局所スケールでも強い遺伝的隔離が起きていることを明らかにした。研究では、島内3地域の湧水地個体群からDNA試料を採取し、ミトコンドリアDNA解析とMIG-seq法による一塩基多型解析を実施した。その結果、生息地間距離が約5kmと近接しているにもかかわらず、個体群間で有意な遺伝的分化が確認され、遺伝子交流が著しく制限されていることが判明した。背景には、道路整備や農地造成による湿地分断に加え、本種が浮遊幼生期を持たず分散能力が低い点があると考えられる。特に一部集団では生息面積が約80㎡と極端に狭く、遺伝的多様性の低下も確認された。研究グループは、近交弱勢や環境変化への適応力低下による絶滅リスク上昇を懸念し、生息地保護区設定や継続的モニタリングなど、より強力な保全政策の必要性を提言している。

絶滅危惧種・ミヤコサワガニの局所スケールでの遺伝的隔離と多様性の低さが明らかに ―保全に向けた基盤情報の提供に貢献―

図1. 宮古島固有種のミヤコサワガニ. 生息環境が減退し, 絶滅の危機に瀕している.

<関連情報>

隔離された島固有のカニ:ミヤコサワガニの局所スケールでの遺伝的集団構造 Isolated island endemic crabs: Fine-scale genetic population structure of an endangered freshwater crab, Geothelphusa miyakoensis

Takefumi Yorisue,Akira Iguchi,Miyuki Nishijima,Kodai Gibu,Saki Higa,Nina Yasuda,Kenji Takata,Kohei Hamamoto & Yoshihisa Fujita

Conservation Genetics  Published:22 April 2026

DOI:https://doi.org/10.1007/s10592-026-01785-8

Abstract

Geothelphusa miyakoensis is an endangered freshwater crab endemic to Miyako Island, in the southern Ryukyu Islands, Okinawa Prefecture, Japan. Due to habitat fragmentation resulting from island development, only four small habitat sites remain. Therefore, conservation priority for G. miyakoensis is extremely high and viability of each population needs to be urgently assessed. In this study, we collected DNA samples from three (Ngtaga-ga, Higa-Upuka and Puikya) of the four habitats and performed genetic analyses based on mitochondrial COI sequences and genome-wide SNPs. We detected significant genetic structure among these populations, indicating that gene flow among them is highly restricted. Furthermore, the reduction in effective population size due to habitat loss raises concerns about the negative effects of inbreeding depression in each population. In particular, Puikya requires special attention due to its extremely limited habitat size (about 80 m2) and the lowest genetic diversity. Moving forward, it is desirable to conserve the remaining habitats and to implement conservation measures for each population. Furthermore, it is important to continue monitoring genetic diversity and population dynamics to ensure that inbreeding depression does not become severe.

1903自然環境保全
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